Emilio Ghilioni nació en Santa Fe el 3 de mayo de 1935. Radicado en Rosario a partir de 1955, inició estudios de arquitectura en la Universidad Nacional del Litoral que concluyó en 1965 ejerciendo desde entonces esa profesión paralelamente a su labor en el campo de la plástica. En 1957 comenzó los cursos de pintura, dibujo y grabado en el taller de Juan Grela con cuyos integrantes expuso grupalmente antes de iniciar su secuencia de muestras individuales. A mediados de la década del 60 integró el Grupo de Vanguardia de Rosario firmando todas sus declaraciones y manifiestos y participando de todas sus muestras, ciclos y acciones compartidas. 

Con posterioridad a los cuestionamientos artísticos e institucionales que rodearon a la obra colectiva Tucumán Arde, a fines de 1968, ingresó en un período de suspensión de la actividad artística que se extendió hasta 1976. En ese año retomó la práctica del arte conformando el Grupo Rosario junto a Roxana Celman, Nélida Curvale, Rodolfo Elizalde, Celia Fontán, Arnoldo Gualino, Claudio Gutiérrez, Alberto Macchiavelli y Daniel Scheimberg; colectivo que se dio como tarea tanto la realización de muestras compartidas como la recuperación y difusión de figuras del pasado artístico rosarino. Disuelto ese conjunto en 1981, fue uno de los impulsores, en 1984, de Artistas Plásticos de Rosario Agremiados. También, a partir de la apertura democrática que se produjo ese último año, ingresó como docente a la Escuela de Bellas Artes de la Facultad de Humanidades y Artes de la Universidad Nacional de Rosario, donde asimismo ejerció cargos de extensión. Además de su intensa actividad expositiva, docente y de gestión, realizó en diferentes momentos estudios sobre artistas de la ciudad que dio a conocer a través de artículos, audiovisuales y conferencias. Su obra se encuentra representada en el Museo Castagnino+macro y en colecciones particulares. Murió en Rosario el 11 de abril de 2021.